O processo de enfermagem surgiu na década de 70 como uma forma de organização dos cuidados de enfermagem, com o objetivo de operacionalizar a metodologia de assistência no Brasil. Posteriormente, na década de 80 foi estabelecido como atribuição privativa do enfermeiro, sendo utilizada para elaboração de um método e estratégia de trabalho do processo saúde/doença, e também como um meio para aplicação de seus conhecimentos técnicos científico. Diante dos benefícios que a Sistematização da Assistência de Enfermagem (SAE) proporciona, pôde-se perceber na vivência acadêmica que os hospitais de Cuiabá apresentam dificuldades em não aderirem à implantação da SAE, o que despertou o interesse neste estudo. O objetivo deste estudo é identificar as dificuldades encontradas pelo Conselho Regional de Enfermagem COREN-MT na implantação da SAE nos Hospitais de Cuiabá-MT. Trata-se de uma pesquisa de caráter exploratório descritivo com abordagem qualitativa realizada no COREN-MT em Cuiabá/MT no primeiro bimestre de 2009, após aprovação do Comitê de Ética da Escola de Saúde Pública, protocolo 399. A amostra foi composta de 06 enfermeiros (as) fiscais que atuam na fiscalização nos hospitais de Cuiabá-MT. Foi utilizado um questionário com perguntas abertas que foi reduzido a um texto, posteriormente agrupado e categorizado. Os dados analisados com bases na análise temáticas revelaram três categorias principais: implantação da Sistematização da Assistência de Enfermagem, Fatores que interferem a implantação da SAE, Capacitação profissional. Evidenciamos nos discursos dos entrevistados que os enfermeiros que atuam nos hospitais de Cuiabá apresentam dificuldades no marco conceitual e nos passos a serem seguidos no processo; as instituições hospitalares não oferecem e não incentivam a implantação da SAE por falta de conhecimento quanto sua importância e vantagens, o que acaba levando a desmotivação do profissional enfermeiro na adesão e implantação da sistematização de enfermagem. Concluimos que ocorrem vários fatores que dificultam a adesão e implantação da SAE nos hospitais de Cuiabá, a SAE é um processo científico que possibilita uma assistência com qualidade, agilidade e com baixo custo. Consideramos relevante maior intervenção do COREN através da fiscalização, do oferecimento de oficinas e capacitações aos enfermeiros e gestores hospitalares transmitindo conhecimento quanto à importância, vantagens e contribuições que a SAE oferece diretamente na assistência do usuário.