Objetivo. Verificar positividade de culturas microbiológicas de pacientes hospitalizados, com prescrição de enfermagem para banho no leito, em três períodos disjuntos e sequenciais das modalidades de banho no leito: convencional (BLC), descartável (BLD) e descartável acrescido de clorexidina degermante à 2% (BLD-CX). Métodos. Estudo ecológico, tipo séries temporais de 48 meses, em três períodos (P1=BLC; P2=BLD; P3=BLD-CX), com dados secundários de prontuário eletrônico, de pacientes que estiveram internados em hospital do estado de São Paulo, Brasil. Resultados. Nos períodos de banhos descartáveis, o percentual de positividade foi, em média, 14,6% menor quando comparado aos meses cujo banho de leito foi convencional. No período de BLD-CX o percentual de positividade foi, em média, 19,3% menor quando comparado aos meses do período de BLC. Contudo, não há evidências de diferença no percentual de positividade entre o BLD (b = -14,6%; IC95% = (-18,9% a -10,3%) e o BLD-CX (b = - 19,3%; IC95% = (-24,4% a -14,22%). A cada ano a mais na idade média do paciente, o percentual de positividade aumenta, em média 0,3% (p=0,060). Não houve associação sazonal para positividades das culturas microbiológicas nas modalidades de banho. Conclusão. A positividade de culturas microbiológicas, em pacientes com prescrição de enfermagem para banho no leito, é menor quando se utiliza as modalidades descartáveis. Recomenda-se adotar rotineiramente o BLD, deixando a prescrição de BLD-CX, somente para degermação da pele para procedimentos invasivos, operatórios e higienização das mãos de profissionais de saúde.